复旦大学上海医学院现有博士研究生1395人，硕士研究生1888人，普通本科生2166人，留学生（本科）141人，专科生720人，成人教育本专科生2675人，共计8985人。有专任教师449人、专职科研人员86人，其中高级职称250人。有中国科学院院士4人（杨雄里、沈自尹、王正敏、葛均波），中国工程院院士5人（汤钊猷、陈灏珠、顾玉东、闻玉梅、周良辅），教育部“长江学者奖励计划”特聘教授17人，国家杰出青年基金获得者22人，“国家重点基础研究发展计划（含重大科学研究计划）”项目首席科学家12人。上海医学院设有本科专业10个：临床医学（八年制）、临床医学（五年制）、临床医学（六年制，全英语授课）、基础医学、法医学、预防医学、公共事业管理（卫生事业管理方向）、药学、药学（临床药学方向）、护理学；高职专业1个：护理。一级学科博士学位授权点5个（基础医学、临床医学、公共卫生与预防医学、中西医结合、药学），博士学位授权学科、专业点68个（含自设学科、专业4个），硕士学位授权学科、专业点45个（含自设学科、专业7个），并设有7个博士后科研流动站(生物学、基础医学、临床医学、公共卫生与预防医学、中西医结合、药学、公共管理（医)。有3个一级国家重点学科：生物学、基础医学、中西医结合，12个二级国家重点学科：内科学（心血管病、肾病、传染病）、儿科学、神经病学、影像医学与核医学、外科学、眼科学、耳鼻咽喉科学、肿瘤学、妇产科学、流行病学与卫生统计学、药剂学、社会医学与卫生事业管理。有国家重点实验室1个（医学神经生物学），教育部重点实验室5个（医学分子病毒学、分子医学、智能化递药、公共卫生安全、癌变与侵袭原理），卫生部重点实验室9个（糖复合物、抗生素临床药理、手功能重建、医学技术评估、医学分子病毒学、听觉医学、近视眼研究、病毒性心脏病、新生儿疾病），上海市重点实验室6个（周围神经显微外科、医学图像处理与计算机辅助技术、器官移植、女性生殖内分泌相关疾病、视觉损害与重建、乳腺肿瘤）。

      学院位于上海繁华的徐家汇东侧（药学院已于2009 年初整体搬迁张江校区），包括东安路两侧的东园、西园、护理学院、放射医学研究所及部分零星分散用地，枫林校区总用地面积19.2万平方米（不含附属医院）。有10个附属医院：复旦大学附属中山医院、复旦大学附属华山医院 、复旦大学附属肿瘤医院、复旦大学附属儿科医院、复旦大学附属妇产科医院、复旦大学附属眼耳鼻喉科医院、复旦大学附属金山医院、复旦大学附属上海市第五人民医院、上海市（复旦大学附属）公共卫生临床中心、复旦大学附属华东医院。