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1910年，由英国、美国和加拿大等国在四川成都华西坝上建立了华西协和大学，并相继成立文、理、医、牙、教育、宗教等学院及相应的系科。1914年，华西协和大学医科在成都建立，加拿大人启真道（L.Kilborn）首先开设了生理学课程，并于1930年出任首任生理、药理系主任。抗日战争时期，随中央大学等院校迁来成都，中国药理、生理学界许多知名教授都曾在我校担任药理、生理学教学并进行科研工作，这些著名前辈们对我们后来的药理学教学活动产生了深远的影响。解放后，为了适应新中国建设事业和高等教育事业发展的需要，为促进高等教育事业和药理生理学事业在全国的发展，在中央政府的领导下，我国的高等教育进行了大调整。在华西协和大学、私立华西协和大学和华西大学的发展历史基础上，组建了四川医学院。1953年药理学从生理药理系分出，单独成立药理教研室，由冯大然教授担任教研室主任。冯大然教授多年来主要从事中药提取的研究，并首先提取及研制出黄连素，在全国药理学界倍受推崇。1960年由著名教授王浴生出任教研室主任，1981年批准为硕士学位授权学科。王浴生教授是我国知名药理学学术带头人，是中国药理学会化疗药理分会的名誉主任委员，在抗生素等化疗药物的研究方面有杰出的贡献，承担完成自然科学基金基础理论研究课题4项，卫生部课题2项，曾经研究已鉴定投产的药物及制剂60余种，为我国化疗药物等开发与基础理论研究做出了重大贡献。获得国家发明奖三等奖二项，省级科技进步二等奖7项，省厅局级及市级成果奖四项。培育药理骨干教师和药理研究人员80余名。主编及参编教材和参考书40余本，并多次荣获药理学教材评比表彰奖。发表科研及教学论文200多篇。名字被载入国外、国内名人传记收戴简历与成就等8部书中。曾应邀访问美国、荷兰、日本、法国、澳洲等国家，并在美国伊利诺大学芝芝加哥医学中心、伊利诺大学药学院担任客座教授。
1982年由包定元教授出任教研室主任，包定元教授是四川省乃至我国药理学学术带头人，一直从事药理学和化疗药物的药理及临床前药理研究工作，并在这些方面做出了重大贡献，多次荣获国家和省的科技进步奖。培育了西南各省的药理骨干教师和药理研究人员近30名，任教以来培养数以万计的医学生。主编及参编教材和参考书20余本，并多次荣获药理学教材评比表彰奖。负责科研项目30余项，其中“第二类抗癌新药米托蒽醌的研究”等获国家科技成果证书，“乐脉颗粒的研究”等获四川省人民政府一等奖。发表科研及教学论文200余篇。
1988年由方治平教授出任教研室主任；2001年由留美归国的周黎明副教授出任教研室主任。多年来，药理学教研室老、中、青几代教师及技术人员为提高药理学的教学水平进行了不懈的努力，在教学内容、教材建设、教学方式及教学条件改善等各方面都取得了显著的成绩。
药理学教材自1953年起一直使用卫生部组织的统编教材《药理学》。到目前为止，统编教材已更新至第六版。我室先后有王浴生、包定元、周黎明等教授参加了统编或规划教材的编写。同时我校教师还主编、参编教育部高等教育出版社五年制药理学教材、吉林科技出版社英文版药理学教材、上海科技出版社出版的高校临床药理学教材、郑州大学出版社出版的五年制临床药理学规划教材、人民卫生出版社出版的临床医学八年制药理学教材，本科生用机能学试验1、2版教材，以及由科学出版社出版的供护理等专业使用的21世纪高等医学院校教材“药理学”等。卫生部于1954年颁布了统一的教学大纲，教学大纲按掌握、熟悉、了解三级划分。近年来，随着药理学学科的发展及知识的更新，我们针对不同专业、不同层次的学生又对教学大纲进行了多次修改。
只有系统掌握理解药理学知识，才能进一步学好其它医学基础课、临床课和现代医学。随着科学技术的迅猛发展，知识信息的爆炸式发展更新，学生要学的课程数目逐渐增多，每门课程的课时必然随之减少，而药理学的研究内容也日益更新，并与各门学科交叉渗透。因此，在有限的时间内既把本门课的基础知识教给学生，又让学生们能了解最新进展，是我们一直以来孜孜以求的目标。为此，四川大学华西药理学课程的发展历经了几代人的艰辛努力，不断探索、求革新、求发展，在教师队伍建设、教学内容及教材、教学方法和手段等各方面与时俱进，取得了显著的成绩。我们教研室是一个极具凝聚力、团结向上、朝气蓬勃的集体。师资队伍逐步年轻化、高学位化。传统的药理学教学内容重在阐明药物对各器官、系统的功能的作用及其机制，随着科学技术的进步、学科交叉及学科本身的发展，目前的药理学教学内容着重从细胞分子水平、器官系统水平及整体水平三个层次结合来阐明药物对各器官、系统的功能的作用及其机制。伴随教学内容的改变，教学形式及方法，也从传统单一的教师讲授转变为教师指导下的学生自学、讨论、学生上讲台以及指导学生对药理学感兴趣的问题查阅资料，写出小综述等多种方式，从而使学生在学到知识的同时，也学会了获取知识的方法，培养了学生分析问题、解决问题的能力。尤其是近年来我们学习国外医学教学的先进经验，在国内率先开展了以病案为基础的讨论，大大提高了学生学习药理学的兴趣，在国内同行中引起了较大的反响。随着国家对高级医学人才需求的增加以及高等教育对外开放，药理学课程面对的学生群体也从本科生增加到七年制学生、研究生以及港澳台学生及留学生，针对不同层次的学生，药理学课堂教学也进一步从仅有的全中文授课转变为中文、双语及全英语教学并存。同时引进了国外原版英文药理学教材，并结合国内的教学实际自编了相应的英文讲义。为满足研究生培养的需要，药理学课程近年还衍生出分子药理学、临床药理学、基础实验药理学、药理学进展等课程。1998以前，药理学实验作为药理学课程的一部分独立进行，为上好实验课，我们编写了实验教材，制作了经典药理学实验的录像， 1999年以后，为适应新的教学、教改形势的需要，药理学、病理生理学及生理学实验课在形势及内容上都进行了重新组合，合并为机能实验课程，重新组建了机能学实验室，编写了全新的机能实验教材。这在全省处于领先地位，在全国也产生了很大影响。
讲授大课从最初的粉笔+挂图+模型，到随后的投影胶片+挂图+模型，到现在的多媒体课件（包括部分动画），极大地提高了上课效率，在有限的时间内给予了最多的知识信息。现相关的教学资料均已上网，师生可上网查询、资源共享。到目前为止我们已制作了供不同专业及不同层次学生使用的教学课件，在学院组织的近五年各类讲课比赛中，我教研室均有教师获奖。
