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《医学微生物学》是微生物学的一个分支，是医学专业主干基础课程。主要研究与医学有关的病原微生物的生物学特性、致病和免疫机制，以及特异性诊断和防治措施，为学习临床各科的感染性疾病、传染病、超敏反应性疾病和肿瘤等奠定重要的理论基础。
《医学微生物学》是人类在探讨传染性疾病的病因、流行规律以及防治措施的过程中，通过长期反复实践、认识、并随着科学的进步逐渐发展和完善起来的科学。近三十年以来，随着分子生物学等学科的发展，使微生物学得到了一些突破性进展，在20世纪生物学发展的三个关键阶段上，微生物学都是站在前列，发挥着不可替代的作用。
我校微生物学教研室，于1941年江西省立赣县高级助产职业学校(赣南医学院前身)建校时成立，原名微生物学与卫生统计学教研室。曾先后更名为赣南医专微寄教研室、赣南医专微生物学教研室、赣南医学院微生物学教研室、赣南医学院微生物学与免疫学教研室。1992年，伴随着免疫学的发展，免疫学从微生物学教研室独立出来，再次更名为赣南医学院微生物学教研室。2000年根据国务院学位办学科调整精神，将医学微生物学和人体寄生虫学两门学科合并为病原生物学，现更名为赣南医学院病原生物学教研室。在历代前辈不懈努力下，病原生物学科得到了长足进步，现为赣南医学院重点学科。医学微生物学为校级精品课程，并于2010被评为省级双语示范课程。
目前，本教研室有专职教师13名，其中高级职称9人(正教授5人、副教授4人)，中级职称以上教师12人；具有博士学位3人；具硕士学位8人。主要承担“医学微生物学”、“人体寄生虫学”及“微生物学检验”等主干课程的教学工作，同时承担“临床真菌学”、“现代医学病毒学”、“应用变态反应学”、“肿瘤标志物”等选修课程的教学工作。面向全校包括临床医学、眼耳鼻喉学、麻醉学、护理学、预防医学、药学等十余个本科、专科专业在内的学生授课。此外，本教研室还拥有专业实验室2532平方米，拥有万元以上仪器设备合计10台(套、件)，仪器价值合计140.5万元，拥有中外藏书合计0.56万册。
教研室老师在完成教学工作的同时积极开展教学研究及科学研究工作。近年来，承担江西省省级教改课题10项，校级教改课题16项；承担科研课题46项，其中国家自然科学基金资助课题1项，省自然科学基金课题7项，省教育厅、省卫生厅课题14项，校级招标课题3项，校级重点课题5项，校级课题17项。近5年发表论文100余篇，其中核心期刊54篇。公开出版教材5部，其中2部获江西省高校优秀教材一等奖；学术专著2部。参加国际学术会议3人次、全国性学术会议14人次、省级学术会议20人次。近五年获江西省高校科技成果一等奖、二等奖各1项；赣州市科技进步二等奖 、三等奖各1项；国家发明专利1项；国家继续教育项目1项。
长期以来，教研室以培养学生的创新意识、素质教育为中心，坚持教学改革，采用启发式、讨论式教学，组织学生进行课堂讨论，让学生充分发表自己的观点，提高分析问题、解决问题的能力，通过辩论会的形式，巩固所学的知识，激发了学习热情，提高了教学质量，深受同学们的欢迎 。
